1925年戴高乐在贝当元帅参谋部担任最高战争委员会副主席。1927年再次被派往特雷夫任营长。1928年1月1日他的小女儿安娜出世。1929年戴高乐被调往地中海东岸地区，与他的家人在贝鲁特度过两年。1931年，他在巴黎的国防部总秘书处任职。这一职位对他至关重要，为他日后处理国家事务奠定了基础。

在此期间，在贝当元帅的许可和支持下，他发表了许多文章，并在军事学院举行了多次报告会。他的独立思想逐渐显示出来，并提出军队首领应该具有“行动果敢”和“有个性”的素质。戴高乐认为有必要进行军队改革，并对军队与政治的关系进行思索。在1924年出版的第一本著作《敌人内部的倾轧》中，他强调政治应优先于军事。在1932年出版的《剑刃》一书中，他强调了培养军事首领和进行战时分析的重要性。1934年，他写成《建立职业军》，在书中提出了有必要建立一支结合机动能力和毁灭性火力，既能够主动出击、又能够出奇制胜的装甲师的理论。根据这一理论应该成立一支职业军队，与常规军配合作战。

然而，这一设想除了得到右派议员保罗·雷诺（Paul Reynaud）和菲利普·塞尔（Philippe Serre）的支持外，没有得到其他人的热烈反响。但是，在国外，尤其在德国，戴高乐提出的使用装甲部队的想法却引起了极大的注意。在巴黎，戴高乐经常拜会以主张改革马奇诺防线防御战略的埃米尔·梅耶上校（Émile Mayer）为首的各界人士。但他们二人的观点都没有被接受。

1937年，戴高乐晋升为上校，在梅兹任第507坦克团团长。1939年9月3日，英法对德宣战时，戴高乐上校指挥第五集团军坦克部队。1940年1月，戴高乐向莱昂·勃鲁姆（Léon Blum）、保罗·雷诺以及甘末林将军（Gamelin）和魏刚将军（Weygand）等八十多人发出了根据他在波兰的经验写成的备忘录《机械部队的诞生》，强调了坦克与飞机配合作战的重要性。1940年5月10日，德国军队使用飞机与装甲车双管齐下的方法突破了法国防线，验证了戴高乐提出的理论。随后，戴高乐奉命指挥第四装甲师，在蒙科尔内（Montcornet）和拉昂（Laon）大获全胜，并于1940年5月27日至30日在阿布维尔（Abbeville）阻断了德军进攻。他因此受到部队嘉奖，被称为“勇敢果断的杰出指挥官”。

1940年6月1日，戴高乐被拔擢为临时准将。6月5日，当时的议会主席保罗·雷诺将其任命为国防和战争部副国务秘书，负责协调与英军的行动，以继续作战。6月9日，他与丘吉尔会晤，并试图劝说丘吉尔增派部队，包括空军部队，但遭到拒绝。6月10日，戴高乐离开了已交到敌人手中的巴黎，前往奥尔良、布里亚尔和图尔。6月16日，他从英国返回到波尔多时，得知议会主席保罗·雷诺已经辞职，由贝当元帅接替。贝当元帅于6月17日要求停战。戴高乐将军于是被排挤出政府。